18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1351 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1351  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  827    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.144812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3701  hypothetical protein  31.43 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4147  hypothetical protein  30.77 
 
 
461 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4022  hypothetical protein  40.82 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3200  putative phage tail protein  36.22 
 
 
478 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.61 
 
 
734 aa  90.1  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2968  hypothetical protein  34.96 
 
 
462 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0977  hypothetical protein  35.11 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1813  hypothetical protein  32.24 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1885  hypothetical protein  32.24 
 
 
458 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0063  hypothetical protein  31.21 
 
 
478 aa  63.2  0.000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0120  hypothetical protein  33.83 
 
 
313 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954008  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0707  hypothetical protein  30.35 
 
 
776 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579988  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03843  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 
618 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0258  hypothetical protein  28.57 
 
 
469 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0313  hypothetical protein  34.35 
 
 
476 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1559  hypothetical protein  26.11 
 
 
425 aa  44.3  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0734  hypothetical protein  28.57 
 
 
768 aa  43.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>