53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1332 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  32.41 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25521  hypothetical protein  28.1 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0174  hypothetical protein  28.73 
 
 
276 aa  89  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0591862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1949  hypothetical protein  30.65 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  27.68 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  25.38 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2764  hypothetical protein  26.07 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  24.86 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2737  hypothetical protein  24.57 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  24.33 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  22.76 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  22.76 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0205  hypothetical protein  25.09 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3873  hypothetical protein  30.22 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.950409 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4078  hypothetical protein  37.14 
 
 
124 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0379122 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  25.56 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4203  sulfotransferase  24.31 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4384  sulfotransferase  27.76 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.754558  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1419  sulfotransferase  24.59 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  27.75 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  27.15 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4005  sulfotransferase  24.36 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  26.81 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0327  sulfotransferase  27.44 
 
 
309 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  22.67 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5381  sulfotransferase  25.83 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  27.82 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0128  hypothetical protein  24.43 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.044474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  22.8 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.1 
 
 
887 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  26.51 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  21.61 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01341  hypothetical protein  25.26 
 
 
272 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  24.42 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.07 
 
 
681 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4937  sulfotransferase  27.51 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  24.16 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  23.2 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4576  sulfotransferase  26.03 
 
 
279 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.723483 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  24.16 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2395  sulfotransferase  25.88 
 
 
311 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.009967  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3772  sulfotransferase  20 
 
 
292 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1971  hypothetical protein  28.28 
 
 
324 aa  45.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.987274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3720  sulfotransferase  20 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1837  sulfotransferase  28.5 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  25.69 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1828  sulfotransferase  25.94 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.436215  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1766  sulfotransferase  22.55 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  0.0849812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1012  sulfotransferase  27.23 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  22.81 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4200  sulfotransferase  22.03 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  24.08 
 
 
623 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>