74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4005 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4005  sulfotransferase  100 
 
 
256 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  44.4 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  44.02 
 
 
260 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0282  hypothetical protein  37.85 
 
 
289 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0128  hypothetical protein  34.16 
 
 
271 aa  129  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.044474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5381  sulfotransferase  35.27 
 
 
281 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4203  sulfotransferase  29.36 
 
 
293 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4937  sulfotransferase  39.34 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  34.8 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2395  sulfotransferase  38.28 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.009967  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4384  sulfotransferase  37.91 
 
 
316 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.754558  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  38.46 
 
 
303 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  34.33 
 
 
285 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  32.23 
 
 
308 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  34.91 
 
 
316 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1012  sulfotransferase  35.92 
 
 
289 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  28.63 
 
 
312 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  32.34 
 
 
623 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  32.51 
 
 
681 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01341  hypothetical protein  31.09 
 
 
272 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  26.29 
 
 
294 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1358  sulfotransferase  30.94 
 
 
247 aa  99  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  36.06 
 
 
328 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.46 
 
 
676 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0561  sulfotransferase  28.25 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4269  sulfotransferase  35.1 
 
 
338 aa  96.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.19629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3100  sulfotransferase  31.63 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3970  sulfotransferase  32.13 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0330664  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  30.5 
 
 
832 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4735  sulfotransferase  29.27 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0327  sulfotransferase  31.46 
 
 
309 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8593  putative deacetylase sulfotransferase  34.93 
 
 
285 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1837  sulfotransferase  32.54 
 
 
304 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  35.15 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1828  sulfotransferase  32.27 
 
 
300 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.436215  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.8 
 
 
887 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  27.78 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4200  sulfotransferase  29.8 
 
 
289 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2236  sulfotransferase  36.07 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1953  sulfotransferase  29.85 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.298171 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1817  sulfotransferase domain protein  30.65 
 
 
320 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1494  sulfotransferase  30.65 
 
 
320 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.750776  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  32.49 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0778  sulfotransferase  31.53 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3141  sulfotransferase  33.64 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.540594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  28.28 
 
 
682 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4736  sulfotransferase  29.81 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3309  sulfotransferase  30 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  22.99 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0166  sulfotransferase  26.67 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000309117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1419  sulfotransferase  25.2 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3798  sulfotransferase  27.05 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0891  sulfotransferase  28.72 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0090  hypothetical protein  37.93 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7214  sulfotransferase  33.33 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1971  hypothetical protein  29.63 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.987274  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  25.89 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4576  sulfotransferase  30.58 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.723483 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3864  sulfotransferase  25.19 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0946  sulfotransferase  32.69 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3772  sulfotransferase  26.32 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3802  sulfotransferase  25.25 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43022  predicted protein  29.85 
 
 
623 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599773  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1766  sulfotransferase  27.83 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  0.0849812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3720  sulfotransferase  25.88 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0722  sulfotransferase  28.26 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0351676  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0455  putative sulfotransferase protein  25.88 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  23.9 
 
 
308 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1782  hypothetical protein  28.43 
 
 
302 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  24.36 
 
 
280 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6521  sulfotransferase domain protein  23.96 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  29.59 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  25.63 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3873  hypothetical protein  24.71 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.950409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>