14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0205 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0205  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0174  hypothetical protein  52.38 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0591862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25521  hypothetical protein  48.72 
 
 
283 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1949  hypothetical protein  36.56 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  29.28 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  28.41 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  25.19 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  26.14 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  25.73 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3873  hypothetical protein  31.48 
 
 
194 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.950409 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4078  hypothetical protein  52.38 
 
 
124 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0379122 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  21.12 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  22.97 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  22.43 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>