77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3223 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  37.44 
 
 
260 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  36.95 
 
 
260 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4005  sulfotransferase  34.8 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  34.27 
 
 
285 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0128  hypothetical protein  32.5 
 
 
271 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.044474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  27.9 
 
 
312 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1358  sulfotransferase  31.34 
 
 
247 aa  99  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0282  hypothetical protein  32.87 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  30.77 
 
 
676 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5381  sulfotransferase  29.92 
 
 
281 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  30.43 
 
 
832 aa  92  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3141  sulfotransferase  31.84 
 
 
284 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.540594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  30.85 
 
 
681 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4203  sulfotransferase  28.1 
 
 
293 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  30.6 
 
 
295 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  30.49 
 
 
308 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  30.54 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  27.27 
 
 
623 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01341  hypothetical protein  29.5 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1828  sulfotransferase  27.8 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.436215  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1971  hypothetical protein  30.96 
 
 
324 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.987274  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  27.86 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  30.52 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1012  sulfotransferase  31.31 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4937  sulfotransferase  29.52 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0722  sulfotransferase  30.1 
 
 
235 aa  82  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0351676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8593  putative deacetylase sulfotransferase  30.74 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0327  sulfotransferase  27.8 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4200  sulfotransferase  28.17 
 
 
289 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0891  sulfotransferase  30.69 
 
 
298 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.29 
 
 
887 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1494  sulfotransferase  29.33 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.750776  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1817  sulfotransferase domain protein  29.33 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1837  sulfotransferase  26.64 
 
 
304 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3100  sulfotransferase  29.76 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4384  sulfotransferase  28.57 
 
 
316 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.754558  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4269  sulfotransferase  26.58 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.19629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  27.03 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4735  sulfotransferase  27.35 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  27.71 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3970  sulfotransferase  28.37 
 
 
293 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0330664  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1419  sulfotransferase  25.6 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.21 
 
 
682 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3864  sulfotransferase  27.52 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2395  sulfotransferase  27.31 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.009967  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3798  sulfotransferase  25.49 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3309  sulfotransferase  28.76 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  27.36 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0561  sulfotransferase  25.32 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4736  sulfotransferase  28.64 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  27.65 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0946  sulfotransferase  24.76 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0166  sulfotransferase  25.23 
 
 
295 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000309117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1953  sulfotransferase  27.27 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.298171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  27.44 
 
 
285 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0778  sulfotransferase  25.24 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  23.64 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  25.98 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1766  sulfotransferase  31.01 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  0.0849812 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44473  predicted protein  30.3 
 
 
652 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3802  sulfotransferase  24.81 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0090  hypothetical protein  30.07 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2236  sulfotransferase  25.94 
 
 
327 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4576  sulfotransferase  26.55 
 
 
279 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.723483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  26.25 
 
 
281 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6521  sulfotransferase domain protein  22.22 
 
 
288 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3772  sulfotransferase  24.37 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18680  sulfotransferase family protein  25.98 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3720  sulfotransferase  24.26 
 
 
292 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  21.61 
 
 
280 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
1037 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45024  predicted protein  26.98 
 
 
560 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0437  hypothetical protein  32.95 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.474392  normal  0.018516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  22.22 
 
 
308 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
685 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  22.18 
 
 
1764 aa  42.4  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>