33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1310 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  32.41 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  29.21 
 
 
308 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0174  hypothetical protein  28.9 
 
 
276 aa  86.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0591862 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3873  hypothetical protein  32.97 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.950409 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25521  hypothetical protein  28.63 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1949  hypothetical protein  28.97 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0205  hypothetical protein  28.08 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  22.65 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  22.65 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2737  hypothetical protein  25.57 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  28.21 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  26.88 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  27.47 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2764  hypothetical protein  22.07 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  24.6 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1971  hypothetical protein  28.52 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.987274  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  25.98 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  26.54 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4078  hypothetical protein  33.94 
 
 
124 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0379122 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  24.19 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  28.45 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  24.33 
 
 
316 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4005  sulfotransferase  29.59 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  27.59 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0090  hypothetical protein  32.05 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4384  sulfotransferase  27.92 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.754558  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  28.2 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0128  hypothetical protein  27.33 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.044474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  23.53 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  24.86 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  26.21 
 
 
328 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  22.15 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>