29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0289 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  966    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  966    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2737  hypothetical protein  36.79 
 
 
287 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2764  hypothetical protein  30.14 
 
 
282 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  28.52 
 
 
282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  24.5 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  22.65 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  25.66 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  22.76 
 
 
280 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  25.1 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  21.09 
 
 
285 aa  60.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  22.02 
 
 
294 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25521  hypothetical protein  25 
 
 
283 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  23.57 
 
 
281 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3100  sulfotransferase  25 
 
 
252 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  18.47 
 
 
271 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  22.94 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1817  sulfotransferase domain protein  22.08 
 
 
320 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1494  sulfotransferase  22.08 
 
 
320 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.750776  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0174  hypothetical protein  25.53 
 
 
276 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0591862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  23.27 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0778  sulfotransferase  23.46 
 
 
302 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  22.53 
 
 
308 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  23.14 
 
 
295 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  21.24 
 
 
316 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2236  sulfotransferase  25 
 
 
327 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0327  sulfotransferase  23.74 
 
 
309 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  27.27 
 
 
303 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2395  sulfotransferase  21.59 
 
 
311 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.009967  normal  0.0858519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>