16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4078 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4078  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  256  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0379122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  37.14 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  33.94 
 
 		 292 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0174  hypothetical protein  53.49 
 
 		 276 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0591862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  63.64 
 
 		 308 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  54.76 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0205  hypothetical protein  52.38 
 
 		 275 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1949  hypothetical protein  50 
 
 		 294 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  40.7 
 
 		 271 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2737  hypothetical protein  41.86 
 
 		 287 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  32.43 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  31 
 
 		 281 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  45 
 
 		 464 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  45 
 
 		 464 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25521  hypothetical protein  43.18 
 
 		 283 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2764  hypothetical protein  28.92 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>