86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1180 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  100 
 
 
271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  27.39 
 
 
294 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  35.45 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5381  sulfotransferase  34.06 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3802  sulfotransferase  30.66 
 
 
279 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  32.83 
 
 
288 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0327  sulfotransferase  27.36 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  34.54 
 
 
681 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  30.6 
 
 
832 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  29.45 
 
 
295 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  28.72 
 
 
308 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0778  sulfotransferase  27.11 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1766  sulfotransferase  26.87 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  0.0849812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  30.73 
 
 
285 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4200  sulfotransferase  34.76 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  28.48 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4576  sulfotransferase  29.29 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.723483 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01341  hypothetical protein  31.31 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  30.81 
 
 
623 aa  95.5  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0166  sulfotransferase  39.06 
 
 
295 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000309117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1012  sulfotransferase  32.24 
 
 
289 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  25.16 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4735  sulfotransferase  32.04 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  29.15 
 
 
682 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2395  sulfotransferase  33.18 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.009967  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  27.97 
 
 
303 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3100  sulfotransferase  31.55 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1953  sulfotransferase  30.05 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.298171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4937  sulfotransferase  31.22 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1419  sulfotransferase  26.17 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  32.61 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8593  putative deacetylase sulfotransferase  31.49 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  27.21 
 
 
308 aa  86.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1971  hypothetical protein  26.23 
 
 
324 aa  87  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.987274  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0561  sulfotransferase  26.21 
 
 
275 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  32.07 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  30.5 
 
 
887 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1817  sulfotransferase domain protein  29.59 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1494  sulfotransferase  29.59 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.750776  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4005  sulfotransferase  32.49 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0722  sulfotransferase  32 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0351676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0946  sulfotransferase  36.36 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4203  sulfotransferase  36.64 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3141  sulfotransferase  28.29 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.540594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3772  sulfotransferase  25.45 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1358  sulfotransferase  29.65 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1837  sulfotransferase  27.16 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  25.5 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4384  sulfotransferase  29.95 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.754558  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4736  sulfotransferase  27.32 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3720  sulfotransferase  25.09 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3970  sulfotransferase  34.56 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0330664  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0128  hypothetical protein  27.27 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.044474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.18 
 
 
676 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3798  sulfotransferase  23.62 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3864  sulfotransferase  27.8 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1828  sulfotransferase  27.16 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.436215  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  27.71 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0455  putative sulfotransferase protein  29.61 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  25.4 
 
 
285 aa  72  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43022  predicted protein  32.71 
 
 
623 aa  69.3  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599773  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  28.81 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  24.33 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  25 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0282  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4269  sulfotransferase  25.4 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.19629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0891  sulfotransferase  25.73 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7214  sulfotransferase  30.2 
 
 
350 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  21.74 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2236  sulfotransferase  29.19 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6521  sulfotransferase domain protein  23.57 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  24.6 
 
 
292 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1782  hypothetical protein  25.89 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0090  hypothetical protein  25.76 
 
 
304 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44473  predicted protein  27.08 
 
 
652 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  18.47 
 
 
464 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  18.47 
 
 
464 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18680  sulfotransferase family protein  24.22 
 
 
277 aa  52.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3309  sulfotransferase  24.51 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2764  hypothetical protein  22.18 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1949  hypothetical protein  21.74 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4078  hypothetical protein  40.7 
 
 
124 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0379122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  24.34 
 
 
347 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  24.75 
 
 
542 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  26.15 
 
 
1077 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24914  predicted protein  22.92 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.516627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>