15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0174 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0174  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0591862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25521  hypothetical protein  48.7 
 
 
283 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0205  hypothetical protein  52.38 
 
 
275 aa  265  7e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1949  hypothetical protein  37.71 
 
 
294 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  28.73 
 
 
280 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  28.9 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  27.08 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  27.14 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  30 
 
 
285 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4078  hypothetical protein  53.49 
 
 
124 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0379122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  25.53 
 
 
464 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  25.53 
 
 
464 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  22.51 
 
 
282 aa  45.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  26.9 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3873  hypothetical protein  26.47 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.950409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>