23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1279 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1279  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  357  4e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3019  hypothetical protein  29.49 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2851  secreted (periplasmic)-like protein  26.67 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110924  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3216  hypothetical protein  27.59 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  31.41 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  27.22 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  25.85 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  24.85 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3630  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  26.35 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  28.67 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  25.6 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2958  hypothetical protein  28.03 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  25.17 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  25.17 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  27.1 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1405  hypothetical protein  27.5 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0410  putative lipoprotein  28.37 
 
 		 160 aa  44.3  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.936059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1023  hypothetical protein  25.93 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659157  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0056  hypothetical protein  21.13 
 
 		 164 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  27.54 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>