More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1253 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
208 aa  410  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  60.31 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  56.12 
 
 
195 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  55.61 
 
 
222 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  57.29 
 
 
199 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  56.92 
 
 
200 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  54.59 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  54.59 
 
 
200 aa  211  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  55.15 
 
 
194 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  55.73 
 
 
199 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  55.79 
 
 
199 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  53.54 
 
 
200 aa  207  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  56.32 
 
 
199 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  52.91 
 
 
194 aa  205  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  60.8 
 
 
212 aa  203  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  54.08 
 
 
217 aa  203  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  53.57 
 
 
217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  53.68 
 
 
199 aa  198  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  56.19 
 
 
204 aa  197  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  55.61 
 
 
206 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  56.85 
 
 
207 aa  194  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  54.69 
 
 
199 aa  194  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  52.26 
 
 
203 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  51.58 
 
 
201 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  52.6 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  47.45 
 
 
202 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  53.06 
 
 
203 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  49.75 
 
 
211 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  49.48 
 
 
197 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  47.96 
 
 
201 aa  171  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  49.74 
 
 
197 aa  171  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
197 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  49.48 
 
 
197 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  47.92 
 
 
194 aa  168  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  54.26 
 
 
198 aa  168  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  48.9 
 
 
204 aa  168  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  48.96 
 
 
207 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  44.56 
 
 
200 aa  155  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  45.92 
 
 
201 aa  151  8e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  48.88 
 
 
229 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  47.51 
 
 
215 aa  143  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  41.58 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  42.37 
 
 
211 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  41.81 
 
 
211 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  37.69 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  42.94 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  40.31 
 
 
201 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  38.46 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  34 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  36.9 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0185  kinase, putative  34.72 
 
 
195 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  37 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  35.96 
 
 
203 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  35.9 
 
 
200 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 
219 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  36.41 
 
 
200 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  36.41 
 
 
200 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  36.41 
 
 
200 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  35.38 
 
 
200 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  36.41 
 
 
200 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  37.85 
 
 
210 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  39.51 
 
 
198 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  36.87 
 
 
220 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  35.9 
 
 
200 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  36 
 
 
201 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  35.38 
 
 
218 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  35.08 
 
 
199 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  32.98 
 
 
206 aa  101  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  35.94 
 
 
200 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  34.36 
 
 
200 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  34.16 
 
 
205 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 
200 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  30.61 
 
 
198 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  35.26 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  35.56 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 
317 aa  99.4  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  35.56 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  31.09 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  30.46 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  34.85 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  37.19 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1479  dephospho-CoA kinase  35.86 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174152  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  35.11 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2418  dephospho-CoA kinase  31 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0117806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  36.27 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  34.39 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
202 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  36.27 
 
 
196 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  36.17 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  34.22 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  36.67 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  34.39 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  33.89 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  36.93 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  31.72 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  29.55 
 
 
200 aa  94.7  9e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>