More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0274 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  100 
 
 
403 aa  815    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  86.08 
 
 
406 aa  660    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  85.01 
 
 
347 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  82.78 
 
 
331 aa  550  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  53.97 
 
 
394 aa  363  3e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  54.92 
 
 
396 aa  360  3e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  51.23 
 
 
391 aa  354  1e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  49.87 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  50.13 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  50.66 
 
 
404 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  48.55 
 
 
401 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  48.35 
 
 
401 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  48.59 
 
 
401 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  50.4 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  50.4 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  50.13 
 
 
404 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  48.15 
 
 
399 aa  325  7e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  48.67 
 
 
402 aa  325  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  47.19 
 
 
422 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  47.64 
 
 
419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  46.89 
 
 
427 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  46.49 
 
 
423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  47.88 
 
 
459 aa  298  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  44.69 
 
 
408 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  51.44 
 
 
348 aa  289  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  51.15 
 
 
348 aa  288  8e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  51 
 
 
356 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  51.28 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  51.37 
 
 
348 aa  282  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  49.54 
 
 
368 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  49.85 
 
 
368 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  50.62 
 
 
371 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  50 
 
 
351 aa  279  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  46.46 
 
 
368 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  49.38 
 
 
366 aa  278  9e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  49.85 
 
 
367 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  49.23 
 
 
362 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  50.57 
 
 
346 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  49.23 
 
 
367 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  50 
 
 
363 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  48.35 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  46.8 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  48.13 
 
 
351 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  42.47 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  51.84 
 
 
345 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  50.91 
 
 
353 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  50.91 
 
 
353 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2453  threonine synthase  49.22 
 
 
360 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351882  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  48.3 
 
 
368 aa  272  9e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  50.31 
 
 
363 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  50.3 
 
 
356 aa  268  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  51.08 
 
 
352 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  51.08 
 
 
352 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  51.08 
 
 
352 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  51.08 
 
 
352 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  51.08 
 
 
352 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  51.08 
 
 
352 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  49.23 
 
 
367 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  48.7 
 
 
352 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  50.77 
 
 
352 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  48.79 
 
 
377 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  48.79 
 
 
377 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  49.24 
 
 
354 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  48.4 
 
 
353 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  47.88 
 
 
351 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  49.39 
 
 
377 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0124  threonine synthase  46.5 
 
 
379 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  50.77 
 
 
352 aa  262  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  50.46 
 
 
352 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  49.55 
 
 
351 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  50 
 
 
352 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1745  L-threonine synthase  53.23 
 
 
365 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0188218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1821  threonine synthase  44.59 
 
 
378 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.540438  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1440  threonine synthase  44.44 
 
 
379 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  50 
 
 
353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  47.83 
 
 
352 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  49.25 
 
 
355 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  52.74 
 
 
353 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30231  threonine synthase  48.61 
 
 
352 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  49.23 
 
 
348 aa  256  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  46.8 
 
 
339 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0634  threonine synthase  44.86 
 
 
376 aa  255  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0474  threonine synthase  44.86 
 
 
376 aa  255  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  48.78 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2355  threonine synthase  48.82 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000649768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  49.85 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  48.61 
 
 
361 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2321  threonine synthase  46.67 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  48.22 
 
 
368 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  47.6 
 
 
360 aa  252  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  47.37 
 
 
370 aa  252  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  48.31 
 
 
359 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  48.46 
 
 
360 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  48.46 
 
 
360 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  48.46 
 
 
360 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1280  threonine synthase  47.43 
 
 
380 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  49.38 
 
 
346 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  48.48 
 
 
348 aa  250  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  51.52 
 
 
356 aa  250  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  48.31 
 
 
359 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>