35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3494 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 464 aa  956    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  37.38 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  39.13 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  39.6 
 
 		 447 aa  285  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  40.35 
 
 		 455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  42.14 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  39.46 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  39.18 
 
 		 462 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  40.09 
 
 		 454 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  39.29 
 
 		 520 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  38.85 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  40.88 
 
 		 459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  39.26 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  40.42 
 
 		 458 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  39.26 
 
 		 456 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  38.99 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  38.65 
 
 		 524 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  38.43 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  35.45 
 
 		 473 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  23.71 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  24 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  25.15 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  23.88 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  32.4 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  24.77 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  35.71 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  34.48 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  38.81 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  32.1 
 
 		 299 aa  45.1  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  43.28 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  43.28 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  40.91 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0245  small GTP-binding protein  26.35 
 
 		 403 aa  43.1  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3129  GTP-binding protein  33.71 
 
 		 213 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144339  normal  0.904032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>