35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1942 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 98 aa  199  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0877  stress responsive A/B barrel domain family protein  68.37 
 
 		 98 aa  140  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06521  hypothetical protein  63.27 
 
 		 98 aa  140  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0682  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  57.14 
 
 		 98 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  43.75 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.46 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0045  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.63 
 
 		 102 aa  76.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.71 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.29 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1061  hypothetical protein  30.3 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3356  stress responsive alpha-beta barrel  26.47 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426339  normal  0.411663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.28 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.28 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0625  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  25.49 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.37 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3400  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.32 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.917675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.39 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  30.39 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  32.35 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  32.35 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  30.39 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0680  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  25.25 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.39 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  32.35 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  32.35 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0181  stress responsive alpha-beta barrel  25.64 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00134163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  25.74 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.8 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3925  stress responsive alpha-beta  24.71 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01204  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 		 110 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.16484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>