24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3903 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  847    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2429  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2760  hypothetical protein  26.84 
 
 
413 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.385888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  26.12 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  21.68 
 
 
484 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  18.55 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
373 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
463 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  22.03 
 
 
369 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  22.03 
 
 
369 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
516 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  18.55 
 
 
432 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  20.51 
 
 
859 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 
522 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  18.47 
 
 
424 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  18.1 
 
 
433 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  19.4 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  25.34 
 
 
378 aa  43.1  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>