22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3698 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  100 
 
 
79 aa  166  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  78.87 
 
 
77 aa  126  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  70.27 
 
 
82 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  71.62 
 
 
78 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  48.65 
 
 
77 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  43.06 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  41.67 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  40.85 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  41.1 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  43.84 
 
 
303 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59858  predicted protein  50 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.382382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  39.44 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  40.58 
 
 
236 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  33.77 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  40.54 
 
 
317 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  41.43 
 
 
308 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  38.89 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  38.89 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  40.54 
 
 
308 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  38.89 
 
 
292 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50959  predicted protein  35.85 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36937 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  30.99 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>