More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3546 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3546  undecaprenol kinase  100 
 
 
264 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.817891  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  60.3 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  59.09 
 
 
258 aa  284  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  54.1 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  51.4 
 
 
280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  57.32 
 
 
263 aa  264  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  51.7 
 
 
281 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  57.26 
 
 
265 aa  255  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.38 
 
 
278 aa  215  5e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  43.66 
 
 
266 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  42.05 
 
 
266 aa  205  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.54 
 
 
278 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.6 
 
 
268 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.22 
 
 
268 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  43.48 
 
 
268 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.08 
 
 
277 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  39.77 
 
 
274 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.69 
 
 
269 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.08 
 
 
277 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.71 
 
 
284 aa  191  8e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.64 
 
 
277 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 
266 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  44.71 
 
 
258 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
268 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.06 
 
 
268 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  40.6 
 
 
269 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
265 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.26 
 
 
274 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.91 
 
 
277 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.62 
 
 
274 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  40.53 
 
 
268 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.78 
 
 
276 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.31 
 
 
270 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1418  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.47 
 
 
265 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1268  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.25 
 
 
263 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
278 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  41.35 
 
 
270 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  43.89 
 
 
267 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  43.89 
 
 
267 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1296  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.25 
 
 
263 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00356905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1270  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.25 
 
 
263 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.033406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  40.53 
 
 
276 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1403  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.25 
 
 
263 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2758  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.42 
 
 
273 aa  185  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000523716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.25 
 
 
263 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0882  undecaprenol kinase  46.67 
 
 
259 aa  185  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0378  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.57 
 
 
265 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.115432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  40.39 
 
 
305 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  39.85 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3908  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.47 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  43.51 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0381  Undecaprenyl-diphosphatase  36.33 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.100133  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  45.74 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.29 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1436  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.47 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.648301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1502  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.47 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1542  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.47 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0270551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.21 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.38 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.43 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.41 
 
 
276 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  37.89 
 
 
293 aa  181  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.36 
 
 
284 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 
263 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
272 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  41.18 
 
 
255 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.92 
 
 
274 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.35 
 
 
278 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  42.47 
 
 
258 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1110  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 
263 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.52 
 
 
270 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.5 
 
 
274 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.53 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.55 
 
 
268 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.68 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.52 
 
 
273 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.52 
 
 
273 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.38 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  42.13 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
273 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  40.15 
 
 
273 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
273 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
273 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
273 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  40.15 
 
 
273 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.03 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.96 
 
 
275 aa  178  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.45 
 
 
277 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>