29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3268 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  100 
 
 		 159 aa  319  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  46.75 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 284 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  33.78 
 
 		 171 aa  87.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  34.64 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  38.93 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  35.46 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  33.77 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  31.65 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  32.37 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  33.12 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  36.88 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  29.53 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  30.34 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  35.37 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  32.88 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  34.55 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  29.13 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  26.92 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.83 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.18 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  41.41 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  30.66 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  24.69 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  28.36 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  23.27 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2374  hypothetical protein  27.78 
 
 		 163 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348169  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3352  hypothetical protein  26.9 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>