18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2806 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2806  protein of unknown function DUF1593  100 
 
 
431 aa  888    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.1118  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0761  protein of unknown function DUF1593  35.64 
 
 
488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0565  signal peptide and transmembrane prediction  35.27 
 
 
478 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390373  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  34.98 
 
 
787 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  34.98 
 
 
787 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  30.56 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  30.56 
 
 
1507 aa  112  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  31.03 
 
 
933 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2122  hypothetical protein  32.2 
 
 
492 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.526696  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2156  hypothetical protein  28.35 
 
 
462 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3215  hypothetical protein  29.51 
 
 
498 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6073  protein of unknown function DUF1593  31.73 
 
 
474 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00550  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  25.91 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0873  hypothetical protein  24.53 
 
 
493 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.390345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2737  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.75 
 
 
337 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07383  conserved hypothetical protein  23.37 
 
 
505 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5802  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.67 
 
 
341 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.435626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2069  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  26.14 
 
 
488 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>