18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1687 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  100 
 
 
844 aa  1740    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  39.86 
 
 
1224 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  37.14 
 
 
1222 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  36.25 
 
 
1223 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  36.67 
 
 
855 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  36.42 
 
 
870 aa  537  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  31.31 
 
 
1263 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
1243 aa  340  8e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  25.93 
 
 
1237 aa  296  9e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  28.08 
 
 
913 aa  288  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  27.92 
 
 
917 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  26.78 
 
 
913 aa  280  8e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  27.28 
 
 
913 aa  278  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  27.4 
 
 
925 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  26.9 
 
 
1228 aa  274  5.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  27.83 
 
 
886 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  26.6 
 
 
474 aa  57.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  22.55 
 
 
416 aa  44.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>