56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0382 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0382  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2913  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  63.45 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0169  uroporphyrinogen-III synthase  63.2 
 
 		 265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3227  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  58.1 
 
 		 261 aa  308  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0100705  normal  0.638132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0556  uroporphyrinogen III synthase HEM4  58.13 
 
 		 249 aa  304  9.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01650  possible uroporphyrinogen-III synthase  57.72 
 
 		 248 aa  298  8e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0486  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  53.94 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.473173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0607  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.84 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.654213  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0202  uroporphyrinogen-III synthase HemD, putative  47.52 
 
 		 248 aa  249  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.76 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.62 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0619  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  26.15 
 
 		 607 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0627947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.13 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.62 
 
 		 526 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2731  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  28.73 
 
 		 563 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  24.24 
 
 		 510 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  27.27 
 
 		 526 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.37 
 
 		 508 aa  52.4  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.88 
 
 		 516 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  24.24 
 
 		 577 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.89 
 
 		 528 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8324  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.02 
 
 		 594 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0487  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.67 
 
 		 607 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1376  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.26 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.86 
 
 		 554 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0263  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  26.77 
 
 		 526 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240357  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  25.91 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.86 
 
 		 554 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.86 
 
 		 554 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.84 
 
 		 567 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.04 
 
 		 525 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.02 
 
 		 604 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  29.35 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.86 
 
 		 571 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4370  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.64 
 
 		 562 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  25.91 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0496  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.51 
 
 		 552 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  24.86 
 
 		 565 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  25.64 
 
 		 558 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.86 
 
 		 569 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.25 
 
 		 509 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4599  uroporphyrinogen-III synthase  24.89 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.28 
 
 		 516 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.13 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0550  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen- III C-methyltransferase  27.32 
 
 		 526 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4554  uroporphyrinogen-III synthase  24.89 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1421  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  26.97 
 
 		 492 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.39 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4308  uroporphyrinogen-III synthase  25.94 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.65 
 
 		 512 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1687  uroporphyrinogen-III methyltransferase/synthase  26.97 
 
 		 492 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0805383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4207  uroporphyrinogen-III synthase  26.94 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0920  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  21.21 
 
 		 506 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.25 
 
 		 493 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  23.88 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 516 aa  42  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>