More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3947 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  81.04 
 
 		 538 aa  885    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  100 
 
 		 538 aa  1101    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  82.71 
 
 		 538 aa  897    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  59.07 
 
 		 536 aa  646    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  71.93 
 
 		 538 aa  789    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  81.23 
 
 		 538 aa  885    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  56.88 
 
 		 537 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  54.17 
 
 		 538 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  54.26 
 
 		 538 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  53.99 
 
 		 538 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  53.99 
 
 		 538 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  52.88 
 
 		 538 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  54.55 
 
 		 538 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  52.03 
 
 		 536 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  52.59 
 
 		 551 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  52.5 
 
 		 539 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  52.13 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  52.96 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  52.59 
 
 		 540 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  52.22 
 
 		 537 aa  552  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  53.33 
 
 		 540 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  52.69 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  48.98 
 
 		 553 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  53.23 
 
 		 538 aa  492  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  47.25 
 
 		 554 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  48.26 
 
 		 530 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  46.58 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.54 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  46.89 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  46.49 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  46.42 
 
 		 534 aa  472  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  45.19 
 
 		 532 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  46.59 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  46.31 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  45.56 
 
 		 536 aa  474  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  45.77 
 
 		 534 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  45.97 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  45.94 
 
 		 535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  46.13 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  45.96 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.31 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  46.61 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  46.49 
 
 		 547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  45.97 
 
 		 535 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  45.04 
 
 		 546 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  45.5 
 
 		 535 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.97 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  44.81 
 
 		 536 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  46.3 
 
 		 533 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  44.95 
 
 		 554 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  45.09 
 
 		 535 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  44.3 
 
 		 535 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  46.01 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  47.34 
 
 		 535 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  46.15 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  46.77 
 
 		 533 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  44.99 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  46.13 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  44.75 
 
 		 535 aa  465  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  44.67 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  46.97 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  45.94 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.24 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  45.74 
 
 		 540 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46 
 
 		 527 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  44.63 
 
 		 535 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  46.15 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  44.81 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  44.65 
 
 		 535 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  45.94 
 
 		 536 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  44.63 
 
 		 536 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  44.89 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.14 
 
 		 533 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  45.97 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  44.85 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  43.83 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  45.9 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3465  propionyl-CoA carboxylase  47.13 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4091  propionyl-CoA carboxylase  46.12 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  44.71 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  45.56 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1643  propionyl-CoA carboxylase  45.69 
 
 		 537 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552875  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7689  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta subunit  47.7 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  45.64 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  45.97 
 
 		 542 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  44.14 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  45.12 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1712  Propionyl-CoA carboxylase  46.41 
 
 		 531 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.284858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  44.94 
 
 		 534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  43.49 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  45.12 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3827  propionyl-CoA carboxylase  47 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  45.64 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  44.94 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  44.94 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  45.34 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  43.17 
 
 		 532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  43.36 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  45.08 
 
 		 534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>