27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3753 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  67.73 
 
 		 220 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  68.18 
 
 		 220 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  73.33 
 
 		 220 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  73.44 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  64.09 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  63.18 
 
 		 228 aa  295  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  38.42 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  35.5 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  41.01 
 
 		 195 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  34.62 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  31.25 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1111  hypothetical protein  31.1 
 
 		 484 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.255858  hitchhiker  0.000181601 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0885  hypothetical protein  27.14 
 
 		 482 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2760  hypothetical protein  27.33 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  26.74 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  26.74 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  26.74 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  26.74 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  26.74 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  26.74 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  26.38 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  28.16 
 
 		 494 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46491  predicted protein  22.47 
 
 		 385 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.427203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2668  hypothetical protein  25.88 
 
 		 494 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0864  hypothetical protein  24.26 
 
 		 189 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.499828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>