35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2593 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2593  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  882    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2767  hypothetical protein  69.89 
 
 		 426 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2928  hypothetical protein  72.35 
 
 		 426 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2853  hypothetical protein  71.89 
 
 		 426 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.570467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2836  hypothetical protein  72.12 
 
 		 426 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39270  hypothetical protein  65.67 
 
 		 421 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.981156  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3087  hypothetical protein  39.56 
 
 		 438 aa  292  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3433  hypothetical protein  39.91 
 
 		 438 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2962  hypothetical protein  48.34 
 
 		 478 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal  0.70516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1022  hypothetical protein  42.78 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0997867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0935  hypothetical protein  46.84 
 
 		 468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4125  hypothetical protein  36.13 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.891706  hitchhiker  0.000117578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2093  hypothetical protein  36.39 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2964  hypothetical protein  41.39 
 
 		 243 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03498  hypothetical protein  30.15 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0447  hypothetical protein  26.4 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2173  hypothetical protein  30.53 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1157  hypothetical protein  28.3 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2450  hypothetical protein  29.09 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2318  hypothetical protein  29.94 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3207  hypothetical protein  25.73 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0323  hypothetical protein  26.1 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3460  hypothetical protein  29.14 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0338  hypothetical protein  25.88 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1018  hypothetical protein  27.83 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5394  hypothetical protein  27.68 
 
 		 478 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5875  hypothetical protein  26.93 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0733  hypothetical protein  27.27 
 
 		 367 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2587  hypothetical protein  27.95 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2423  SH3 type 3 domain-containing protein  29.04 
 
 		 682 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000143632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0784  hypothetical protein  36.2 
 
 		 299 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205821  normal  0.0100164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41760  hypothetical protein  25.94 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3544  hypothetical protein  25.94 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2535  hypothetical protein  26.07 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284789  normal  0.0200909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1800  hypothetical protein  28.68 
 
 		 336 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>