20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2467 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2467  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  180  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3736  hypothetical protein  40.78 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0199045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  57.58 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  57.58 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3162  hypothetical protein  47.31 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3748  hypothetical protein  46.24 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277851  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0670  hypothetical protein  43.33 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3548  hypothetical protein  54.55 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.757792  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  43 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2277  hypothetical protein  54.41 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3134  hypothetical protein  49.23 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  52.38 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3545  hypothetical protein  41.05 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  38.57 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  47.06 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2088  hypothetical protein  48.44 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3304  hypothetical protein  41.67 
 
 		 125 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  38.24 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4001  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.208637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5706  hypothetical protein  44.12 
 
 		 126 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  0.293458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>