38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2663 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  219  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0170256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  95.24 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1692  putative lipoprotein  55.88 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  53.33 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  53.33 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  53.33 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  50.49 
 
 		 100 aa  110  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1725  putative lipoprotein  55.88 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1809  lysozyme inhibitor  39.05 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0953992  hitchhiker  0.00103718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  42.86 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  42.86 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  39.62 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  38.1 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  38.1 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  44.34 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  38.1 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  38.1 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  44.34 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  42.86 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  42.86 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  40.95 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2054  hypothetical protein  44.26 
 
 		 236 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  37.7 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0866  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  30.3 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  30.3 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  39.62 
 
 		 151 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  32.93 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  32.93 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  32.93 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  32.93 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  32.93 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  32.93 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  32.93 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  29.69 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.71 
 
 		 231 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>