49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2584 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2584  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2285  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  91.51 
 
 
273 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1786  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  76.3 
 
 
272 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  72.79 
 
 
275 aa  411  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0231238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  57.72 
 
 
273 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  57.35 
 
 
273 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  59.56 
 
 
284 aa  320  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1601  S1A family peptidase  58.09 
 
 
273 aa  315  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2045  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.72 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2032  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.72 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1672  S1A family peptidase  57.72 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01567  predicted peptidase  57.35 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01557  hypothetical protein  57.35 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2308  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  57.35 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1914  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.3 
 
 
273 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1653  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.56 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1689  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.43 
 
 
273 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1856  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.05 
 
 
273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1585  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.17 
 
 
273 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1594  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.05 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1818  putative protease  58.2 
 
 
278 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.276727  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1928  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.79 
 
 
278 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2221  putative protease  57.79 
 
 
278 aa  297  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  normal  0.0142716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.46 
 
 
407 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1061  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.81 
 
 
392 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.25 
 
 
444 aa  85.5  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0562  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.04 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  29.36 
 
 
438 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6487  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.93 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal  0.537823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1017  hypothetical protein  27.23 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2499  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.86 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.8152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6589  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.8 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.42 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2677  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.93 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.206347 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.07 
 
 
308 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.23 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3870  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.98 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381298  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2893  hypothetical protein  25.97 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0812422  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.2 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4890  peptidase S1, chymotrypsin  25.55 
 
 
500 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.75 
 
 
321 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4892  trypsin domain-containing protein  26.64 
 
 
511 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  24.87 
 
 
416 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.5 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  29.11 
 
 
323 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  23.9 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.29 
 
 
363 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  29.11 
 
 
322 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>