More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4991 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  64.92 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.88 
 
 		 327 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  61.18 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.8 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.43 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  60.12 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.92 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.49 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.51 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.74 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  58.59 
 
 		 327 aa  394  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  60.74 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  58.33 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.35 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.43 
 
 		 327 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.43 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  60.43 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  60.43 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.46 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  60.92 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  59.2 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  59.51 
 
 		 327 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.2 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.9 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  57.67 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.98 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  58.95 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.51 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  56.13 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  58.39 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  58.46 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.96 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  59.08 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  57.91 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  61.16 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  57.45 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  58.64 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.61 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  59.2 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  59.2 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  57.1 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.48 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.67 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  57.36 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.97 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.85 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.79 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  58.15 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.59 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.08 
 
 		 327 aa  362  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.1 
 
 		 329 aa  362  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.69 
 
 		 329 aa  362  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.62 
 
 		 325 aa  361  9e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  58.02 
 
 		 328 aa  361  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.64 
 
 		 328 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  54.6 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.76 
 
 		 327 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  56.13 
 
 		 327 aa  355  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  55.38 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  56.17 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  58.28 
 
 		 738 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  57.45 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.99 
 
 		 329 aa  338  8e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.85 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.11 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.53 
 
 		 326 aa  335  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  54.01 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  54.94 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.63 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.23 
 
 		 325 aa  328  8e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  54.32 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.23 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 326 aa  325  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.31 
 
 		 326 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.08 
 
 		 336 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 		 326 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 326 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.01 
 
 		 332 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  54.94 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.08 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.69 
 
 		 326 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  49.69 
 
 		 326 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  52.47 
 
 		 331 aa  322  7e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  50.77 
 
 		 324 aa  322  8e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06860  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.82 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0708364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1107  alcohol dehydrogenase  52.62 
 
 		 331 aa  321  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  50.15 
 
 		 324 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  50.15 
 
 		 324 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  50.15 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  50.15 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>