More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2286 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  75.65 
 
 
501 aa  809    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  71.03 
 
 
496 aa  730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  73.11 
 
 
502 aa  772    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  70.72 
 
 
502 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  69.25 
 
 
504 aa  740    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  100 
 
 
498 aa  1027    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  75.85 
 
 
501 aa  811    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  77.84 
 
 
501 aa  826    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  73.61 
 
 
504 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  68.9 
 
 
512 aa  729    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  70.12 
 
 
502 aa  732    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  50.6 
 
 
509 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  48.8 
 
 
505 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  50.29 
 
 
516 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  48.61 
 
 
505 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  48.8 
 
 
505 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  50.2 
 
 
511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  48.21 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  49.31 
 
 
516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  49.31 
 
 
516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  49.51 
 
 
516 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  48.51 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  50.5 
 
 
518 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  49.6 
 
 
511 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  50.2 
 
 
511 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  47.81 
 
 
510 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  46.93 
 
 
501 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  46.93 
 
 
501 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  47.05 
 
 
515 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  47.13 
 
 
513 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  48.01 
 
 
503 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  46.93 
 
 
517 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  47.04 
 
 
512 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  48.01 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  47.13 
 
 
517 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  47.13 
 
 
517 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  47.13 
 
 
522 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  47.13 
 
 
522 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  47.13 
 
 
522 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  47.13 
 
 
522 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  47.13 
 
 
522 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  46.87 
 
 
594 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  42.46 
 
 
520 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  41.39 
 
 
503 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  32.29 
 
 
489 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  31.24 
 
 
482 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  29.39 
 
 
476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  33.33 
 
 
497 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  30.08 
 
 
474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  28.22 
 
 
497 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  28.22 
 
 
497 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  28.22 
 
 
497 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  29.93 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.78 
 
 
497 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.78 
 
 
497 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  31.72 
 
 
535 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  27.78 
 
 
497 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  29.77 
 
 
487 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  31.78 
 
 
511 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  30.37 
 
 
496 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  29.63 
 
 
497 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.99 
 
 
473 aa  144  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  27.73 
 
 
586 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  29.02 
 
 
519 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  27.62 
 
 
499 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.69 
 
 
526 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  29.36 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  27.65 
 
 
493 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  28.53 
 
 
565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  27.78 
 
 
481 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.86 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  27.94 
 
 
549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  28.7 
 
 
480 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  25.6 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  28.77 
 
 
518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  27.4 
 
 
519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  27.57 
 
 
523 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.85 
 
 
479 aa  126  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  27.75 
 
 
486 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  25.7 
 
 
480 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  27.57 
 
 
489 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  27.08 
 
 
514 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  23.75 
 
 
512 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  28.85 
 
 
478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  25.7 
 
 
497 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  28.37 
 
 
483 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  29.96 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.35 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  26.05 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  26.96 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.35 
 
 
497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  23.08 
 
 
458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.35 
 
 
497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.35 
 
 
497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  26.38 
 
 
536 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  25.66 
 
 
508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  27.64 
 
 
554 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.44 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  26.54 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  27.57 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>