25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1906 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1906  TonB-like  100 
 
 
334 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.338738  normal  0.207358 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1664  TonB/TolA energy transducing protein  78.07 
 
 
337 aa  441  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0106366  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  51 
 
 
331 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1247  TonB-like  37.14 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0777  TonB family protein  33.33 
 
 
141 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.114118  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  36.78 
 
 
137 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  33.33 
 
 
231 aa  46.2  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  29.29 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  29.29 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  40.98 
 
 
507 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  38.1 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  33.33 
 
 
231 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  36.92 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  35.63 
 
 
137 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  33.7 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  33.33 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  35.21 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  34.85 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  34.85 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  33.82 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  33.77 
 
 
280 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  30.34 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  35.96 
 
 
288 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  33.33 
 
 
244 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  33.33 
 
 
244 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>