240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0932 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  100 
 
 		 268 aa  533  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  79.1 
 
 		 268 aa  427  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  71.27 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  66.42 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  70.3 
 
 		 268 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  63.7 
 
 		 271 aa  349  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  54.17 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  46.77 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.11 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.97 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.91 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.35 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.11 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.97 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  45.8 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.07 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.35 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  41.83 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.06 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.42 
 
 		 277 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.42 
 
 		 277 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.92 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.92 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  40.3 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.54 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.39 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.26 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  39.77 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.74 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.49 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.74 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.87 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  33.33 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  25.61 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  25.42 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  36.84 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  27.46 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  26.34 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  32.73 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  34.55 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  32.73 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  31.36 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  27.2 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  30.36 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  25.61 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  31.53 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  34.86 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  37.61 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  32.71 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1531  uridylate kinase  32.43 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  33.64 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03235  uridylate kinase  35.45 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  34.55 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  27.03 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  35.96 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  25.45 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  33.65 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002748  uridylate kinase  35.19 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000503391  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  34.55 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01375  uridylate kinase  31.19 
 
 		 155 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00470454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  25.34 
 
 		 236 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  34.21 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  32.08 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  34.21 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  35.4 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  34.21 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  34.19 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  31.82 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  33.91 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  32.46 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  31.82 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  25.62 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  32.41 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  25.11 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  31.9 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  30.63 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  30.17 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  25.22 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  32.04 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  33.63 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  25.22 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  25.62 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  30 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  30.91 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  33.33 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  32.04 
 
 		 240 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  30.17 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  25.22 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  27.16 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  31.9 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  30.91 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  27.16 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  30.56 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  33.03 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  34.86 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  31.82 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  31.82 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  31.82 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  31.82 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  32.11 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>