More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0375 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  100 
 
 		 347 aa  696    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  85.01 
 
 		 403 aa  565  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  84.73 
 
 		 406 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  82.78 
 
 		 331 aa  541  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  55.59 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  53.91 
 
 		 394 aa  332  5e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  55.38 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  53.19 
 
 		 404 aa  316  5e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  52.58 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  49.71 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  53.03 
 
 		 403 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  52.73 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  49.85 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  52.12 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  50.91 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  53.68 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  51.15 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  48.54 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  50.77 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  47.54 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  49.27 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  52.28 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  48.83 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  50 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  50.31 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  50 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  50.62 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  47.06 
 
 		 368 aa  282  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  50.31 
 
 		 351 aa  281  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  48.66 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  47.65 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  49.85 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  47.55 
 
 		 368 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  49.23 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  50.3 
 
 		 459 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  51.84 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  48.43 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  51.08 
 
 		 352 aa  275  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  51.08 
 
 		 352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  51.08 
 
 		 352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  48.3 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  48.3 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  51.08 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  51.08 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  51.08 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  47.73 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  46.99 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  47.84 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  48.46 
 
 		 368 aa  272  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  50.15 
 
 		 351 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  50.62 
 
 		 363 aa  273  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  47.99 
 
 		 346 aa  271  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  49.85 
 
 		 352 aa  271  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  50.77 
 
 		 352 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  50.77 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  49.7 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  50.46 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  49.7 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  47.53 
 
 		 349 aa  268  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  50 
 
 		 377 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  48.94 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  49.24 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  49.24 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  49.24 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2453  threonine synthase  47.71 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351882  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  48.3 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0124  threonine synthase  45.92 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  50.47 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  49.07 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30231  threonine synthase  48.01 
 
 		 352 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  48.92 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  49.08 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  49.7 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  48.39 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  50 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1821  threonine synthase  44.59 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.540438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  50.15 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  48.78 
 
 		 348 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  48.79 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2321  threonine synthase  47.53 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  48.17 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  48.77 
 
 		 353 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  45.14 
 
 		 432 aa  255  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  48.48 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  46.78 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  48.36 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  48.92 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  48.16 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1440  threonine synthase  43.09 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  48.3 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  47.56 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  48.92 
 
 		 339 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  48.48 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  48.22 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1745  L-threonine synthase  51.94 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0188218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  48.8 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2355  threonine synthase  48.82 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000649768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  49.24 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  51.83 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29950  threonine synthase  49.23 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.205881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>