54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4149 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  52.27 
 
 		 190 aa  194  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  48.12 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  44.79 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  31.49 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1531  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.009595  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  36.65 
 
 		 259 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  31.75 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  36.65 
 
 		 259 aa  88.6  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1395  putative lipoprotein  33.5 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.483754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  31.32 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  31.49 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  31.58 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  30.26 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  30.26 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  30.26 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  28.72 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  28.06 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  29.95 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  29 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  27.98 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  28.65 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.65 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  29.5 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  27.81 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  26.53 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  30.27 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  24.74 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  26.37 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  29.53 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  30.17 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  27.81 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>