176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3743 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3743  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00289398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0036  MOSC  34.6 
 
 
234 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5027  MOSC domain-containing protein  34.91 
 
 
233 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03773  MOSC domain containing protein  38.28 
 
 
214 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  35.89 
 
 
241 aa  144  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  32.56 
 
 
234 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3061  MOSC domain-containing protein  32 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068485  normal  0.778276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3024  mosc domain-containing protein  35.71 
 
 
239 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.076191  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2577  MOSC domain containing protein  36.55 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4291  MOSC domain-containing protein  31.53 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0802  MOSC domain-containing protein  33.02 
 
 
235 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  34.72 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0651  hypothetical protein  31.43 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1580  MOSC domain-containing protein  31.08 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000909232  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_004310  BR1762  MOSC domain-containing protein  30.84 
 
 
242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0722092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1700  MOSC domain-containing protein  30.84 
 
 
242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000356858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06890  hypothetical protein  35.42 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59857  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0998  MOSC domain-containing protein  30.81 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.759805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1959  MOSC domain-containing protein  30.81 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1159  MOSC domain-containing protein  30.81 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0955  MOSC domain-containing protein  30.81 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0870  MOSC domain-containing protein  30.81 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1005  MOSC domain-containing protein  30.81 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0278  MOSC domain-containing protein  30.81 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0356222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0270  MOSC domain-containing protein  35.75 
 
 
231 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112146  hitchhiker  0.00000109327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3752  MOSC domain-containing protein  35.75 
 
 
231 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  34.72 
 
 
234 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0277  MOSC domain containing protein  32.63 
 
 
237 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4406  MOSC domain-containing protein  32.47 
 
 
232 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0712401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4456  hypothetical protein  34.72 
 
 
231 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0269  MOSC domain-containing protein  34.88 
 
 
231 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.480151  hitchhiker  0.0000407513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0273  MOSC domain-containing protein  35.23 
 
 
231 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0281  MOSC domain-containing protein  35.23 
 
 
231 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0280  MOSC domain-containing protein  34.72 
 
 
229 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.077384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0630  hypothetical protein  34.38 
 
 
233 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4616  MOSC domain-containing protein  29.05 
 
 
234 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111886  hitchhiker  0.00165938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1774  MOSC domain-containing protein  32.14 
 
 
209 aa  121  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000110547  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3720  MOSC domain containing protein  35.12 
 
 
241 aa  121  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4797  MOSC domain-containing protein  34.72 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0572  MOSC domain-containing protein  30.52 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0083  MOSC domain-containing protein  32.08 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0145195  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0385  MOSC domain-containing protein  33.02 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4660  MOSC domain containing protein  31.75 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.287736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5247  MOSC domain-containing protein  30.35 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5612  MOSC domain-containing protein  30.35 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882843  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0078  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3520  hypothetical protein  34.83 
 
 
229 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344482  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1921  MOSC domain-containing protein  30.52 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0079  MOSC family protein  30.85 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138915  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4891  MOSC domain-containing protein  30.88 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0553056 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4456  MOSC domain-containing protein  29.66 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267556  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0963  MOSC domain-containing protein  31.98 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5441  MOSC domain-containing protein  30.88 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165299  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0079  hypothetical protein  33.51 
 
 
223 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2108  MOSC domain-containing protein  32.47 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4809  MOSC domain containing protein  36.63 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.359001 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  37.58 
 
 
234 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4123  MOSC domain-containing protein  33.71 
 
 
232 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2076  hypothetical protein  31.98 
 
 
228 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3877  MOSC  30.5 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.913671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  33.67 
 
 
549 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1502  mosc domain-containing protein  29.72 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4444  hypothetical protein  31.98 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5365  hypothetical protein  32.49 
 
 
224 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326759  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4178  MOSC domain-containing protein  32.12 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0596789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03796  hypothetical protein  31.98 
 
 
224 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4074  MOSC domain containing protein  31.98 
 
 
224 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03745  hypothetical protein  31.98 
 
 
224 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4390  hypothetical protein  31.98 
 
 
224 aa  108  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4107  hypothetical protein  31.98 
 
 
224 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4303  hypothetical protein  31.98 
 
 
224 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.445001  hitchhiker  0.00595644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4141  hypothetical protein  31.98 
 
 
224 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4454  hypothetical protein  32.63 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4386  hypothetical protein  32.63 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325107  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001034  hypothetical protein  32.08 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.907247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4342  hypothetical protein  32.63 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000280654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4302  hypothetical protein  32.63 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4273  hypothetical protein  31.94 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.833084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4906  MOSC domain-containing protein  29.17 
 
 
227 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00092  mosc domain protein  33.7 
 
 
237 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1855  mosc domain-containing protein  31.46 
 
 
229 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4551  hypothetical protein  32.12 
 
 
215 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00426926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0191  MOSC domain-containing protein  30.43 
 
 
242 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2475  MOSC domain containing protein  29.72 
 
 
215 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1436  MOSC domain-containing protein  27.83 
 
 
226 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4330  hypothetical protein  31.09 
 
 
215 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4665  hypothetical protein  31.09 
 
 
215 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4513  hypothetical protein  31.09 
 
 
215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.405643 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1701  MOSC domain-containing protein  26.67 
 
 
219 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4062  hypothetical protein  32.64 
 
 
224 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00109067  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4167  MOSC domain-containing protein  31.09 
 
 
215 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4279  MOSC domain-containing protein  31.09 
 
 
215 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158056  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2350  MOSC domain-containing protein  30 
 
 
244 aa  101  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.734532 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0030  MOSC domain containing protein  29.02 
 
 
230 aa  101  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0210  MOSC domain containing protein  28.42 
 
 
242 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0213  hypothetical protein  32.34 
 
 
266 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  30.99 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0684  hypothetical protein  30.57 
 
 
215 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2246  MOSC domain-containing protein  28.97 
 
 
229 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00173443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4566  hypothetical protein  30.57 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>