82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2584 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1007  hypothetical protein  44.05 
 
 		 771 aa  700    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001078  hypothetical protein  45.41 
 
 		 748 aa  708    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259566  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2584  hypothetical protein  100 
 
 		 777 aa  1599    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0639598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2143  hypothetical protein  69.3 
 
 		 757 aa  1132    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  28.81 
 
 		 809 aa  292  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3287  hypothetical protein  28.18 
 
 		 813 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  22.62 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  23.55 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2555  PHP domain protein  26.72 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  22.18 
 
 		 480 aa  60.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  28.85 
 
 		 225 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  39.39 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  34.55 
 
 		 279 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2798  hypothetical protein  22.4 
 
 		 475 aa  54.7  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.44646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1683  PHP domain protein  36.9 
 
 		 301 aa  53.9  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2507  PHP domain protein  46.77 
 
 		 282 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3849  phosphotransferase domain-containing protein  27.03 
 
 		 497 aa  52.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1406  PHP domain-containing protein  40 
 
 		 403 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  28.91 
 
 		 228 aa  51.6  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2487  phosphoesterase, PHP-like  31.3 
 
 		 255 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0704  PHP domain protein  40 
 
 		 280 aa  50.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  28.8 
 
 		 486 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  30.77 
 
 		 287 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  37.1 
 
 		 274 aa  50.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1370  PHP domain protein  31.3 
 
 		 267 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  26.09 
 
 		 228 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  37.88 
 
 		 285 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1926  hypothetical protein  30.12 
 
 		 295 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  26.67 
 
 		 269 aa  48.5  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5406  PHP-like metal-dependent phosphoesterase  30.23 
 
 		 279 aa  48.9  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  31.43 
 
 		 286 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5876  hypothetical protein  37.33 
 
 		 401 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00230723  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  35.38 
 
 		 280 aa  48.5  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  31.71 
 
 		 286 aa  48.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  26.92 
 
 		 221 aa  47.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3414  phosphoesterase PHP domain protein  25 
 
 		 291 aa  48.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.91966 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  28.57 
 
 		 286 aa  47.8  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  47.8  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1467  PHP domain protein  30.43 
 
 		 266 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2402  hypothetical protein  32.26 
 
 		 272 aa  47.8  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  33.33 
 
 		 407 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  25.32 
 
 		 458 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  36.36 
 
 		 287 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  35.38 
 
 		 285 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  25.58 
 
 		 277 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  32.31 
 
 		 286 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  32.31 
 
 		 286 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  24.35 
 
 		 460 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  36.36 
 
 		 303 aa  46.6  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 286 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  40.32 
 
 		 296 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  36.92 
 
 		 278 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  37.18 
 
 		 280 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2114  hypothetical protein  32.26 
 
 		 272 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  38.46 
 
 		 277 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  37.1 
 
 		 281 aa  46.2  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  34.85 
 
 		 287 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2010  phosphotransferase domain-containing protein  32.31 
 
 		 276 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000228692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  28.57 
 
 		 286 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  32.31 
 
 		 279 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2137  phosphotransferase domain-containing protein  32.31 
 
 		 276 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  26.88 
 
 		 286 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  32.31 
 
 		 279 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  26.74 
 
 		 276 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  26.74 
 
 		 276 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  32.31 
 
 		 279 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1616  hypothetical protein  27.07 
 
 		 334 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  33.87 
 
 		 293 aa  45.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4132  hypothetical protein  25 
 
 		 482 aa  45.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2521  PHP domain protein  27.73 
 
 		 331 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.428127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3826  PHP-like  25.98 
 
 		 289 aa  45.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596413  normal  0.059434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  27.32 
 
 		 235 aa  45.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1919  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 335 aa  45.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  26.09 
 
 		 228 aa  45.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  36.92 
 
 		 284 aa  44.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  30.67 
 
 		 286 aa  44.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  32.31 
 
 		 322 aa  44.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  30 
 
 		 286 aa  44.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2462  PHP, C-terminal  25.74 
 
 		 295 aa  44.3  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.735424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  30.38 
 
 		 294 aa  44.3  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 284 aa  44.3  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  24.76 
 
 		 285 aa  43.9  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>