24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001078 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2584  hypothetical protein  45.41 
 
 
777 aa  708    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0639598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1007  hypothetical protein  61.59 
 
 
771 aa  943    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001078  hypothetical protein  100 
 
 
748 aa  1539    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2143  hypothetical protein  46.58 
 
 
757 aa  717    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544193  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3287  hypothetical protein  30.12 
 
 
813 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  28.18 
 
 
809 aa  278  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  28.27 
 
 
228 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  27.32 
 
 
228 aa  56.6  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  24.09 
 
 
452 aa  54.3  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  25.85 
 
 
228 aa  52  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3414  phosphoesterase PHP domain protein  22.83 
 
 
291 aa  51.6  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.91966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  26.8 
 
 
486 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  21.15 
 
 
480 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1683  PHP domain protein  31.73 
 
 
301 aa  48.5  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  28.08 
 
 
225 aa  47.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  22.08 
 
 
460 aa  48.1  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0704  PHP domain protein  35.38 
 
 
280 aa  47  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  28.87 
 
 
294 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4309  phosphotransferase domain-containing protein  22.96 
 
 
300 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  38.81 
 
 
286 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  34.85 
 
 
286 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  32.14 
 
 
249 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2007  PHP domain protein  29.82 
 
 
252 aa  44.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  34.85 
 
 
280 aa  44.3  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>