38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1309 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  31.58 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  30.49 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  28.17 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  23.84 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  26.76 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  23.26 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  29.19 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  28.48 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  28.28 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  32.99 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  27.59 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  27.59 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  24.48 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  27.59 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  25.87 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  25.87 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  25.87 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  25.17 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  26.17 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  25.87 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  27.2 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  28.46 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  23.03 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  31.03 
 
 		 313 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  27.42 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  30.19 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  27.18 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  21.37 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  26.13 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  21.19 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  22.37 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  22.11 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0953  hypothetical protein  23.48 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000058701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  23.66 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  25.41 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  25.41 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>