More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0317 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  100 
 
 		 537 aa  1105    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  57.43 
 
 		 538 aa  631  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  56.88 
 
 		 538 aa  631  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  57.62 
 
 		 538 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  56.88 
 
 		 538 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  55.47 
 
 		 538 aa  611  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  48.7 
 
 		 538 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  48.42 
 
 		 539 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.7 
 
 		 536 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  47.87 
 
 		 536 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  48.7 
 
 		 538 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  48.7 
 
 		 538 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  50 
 
 		 538 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  48.05 
 
 		 539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  48.89 
 
 		 538 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  47.31 
 
 		 538 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  47.96 
 
 		 551 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  48.42 
 
 		 540 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  48.05 
 
 		 540 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  48.05 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  47.6 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  46.11 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  46.95 
 
 		 553 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  44.01 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  43.46 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  43.83 
 
 		 535 aa  438  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  47.17 
 
 		 530 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  44.26 
 
 		 532 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  47.17 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  42.78 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  45.6 
 
 		 538 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  44.71 
 
 		 529 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  43.26 
 
 		 534 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  47.17 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  43.23 
 
 		 537 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  44.51 
 
 		 527 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  42.8 
 
 		 535 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  41.62 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  42.8 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  43.41 
 
 		 535 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  43.41 
 
 		 535 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  42.88 
 
 		 535 aa  425  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  41.96 
 
 		 535 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  44.02 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  42.44 
 
 		 535 aa  425  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  42.37 
 
 		 530 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  44.34 
 
 		 549 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  42.44 
 
 		 535 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  40.56 
 
 		 536 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  42.99 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  43.3 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  44.1 
 
 		 529 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  42.25 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  42.99 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  43.25 
 
 		 532 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  42.99 
 
 		 535 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7689  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta subunit  44.76 
 
 		 511 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  41.62 
 
 		 535 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  41.5 
 
 		 546 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  43.33 
 
 		 533 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  42.45 
 
 		 535 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3264  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  42.88 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.399585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  41.71 
 
 		 554 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  43.52 
 
 		 533 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  41.53 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  40.56 
 
 		 536 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  41.32 
 
 		 535 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  40.93 
 
 		 534 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  42.6 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4377  Propionyl-CoA carboxylase  43.13 
 
 		 536 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  40.37 
 
 		 536 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  43.82 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  41.62 
 
 		 535 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  41.73 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  42.25 
 
 		 536 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  42.59 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  40.26 
 
 		 540 aa  415  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1300  propionyl-CoA carboxylase  43.98 
 
 		 534 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122048  normal  0.144625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1031  Propionyl-CoA carboxylase  42.71 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1857  propionyl-CoA carboxylase  42.25 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  42.05 
 
 		 535 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  44.72 
 
 		 528 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  40.37 
 
 		 542 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  43.66 
 
 		 535 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  39.85 
 
 		 535 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3637  propionyl-CoA carboxylase  43.69 
 
 		 534 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.742918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  40.93 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6413  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  43.63 
 
 		 522 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0804402  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  40.3 
 
 		 535 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  42.42 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  42.21 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1643  propionyl-CoA carboxylase  43.22 
 
 		 537 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552875  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1145  propionyl-CoA carboxylase  43.15 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.992894  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  41.14 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  42.31 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  40.11 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  42.86 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  40.3 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  41.76 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  39.48 
 
 		 535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>