241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1279 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  34.66 
 
 
1253 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  36.37 
 
 
1198 aa  765    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0749  cobalamin biosynthesis protein CobN, putative  35.9 
 
 
1244 aa  780    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  37.17 
 
 
1266 aa  817    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  35.81 
 
 
1254 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  35.04 
 
 
1220 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  34.24 
 
 
1254 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0319  cobaltochelatase subunit CobN  36.56 
 
 
1209 aa  752    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  36.7 
 
 
1199 aa  748    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  35.35 
 
 
1273 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  32.89 
 
 
1343 aa  708    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  34.74 
 
 
1253 aa  691    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  35.98 
 
 
1269 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  33.93 
 
 
1288 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  33.98 
 
 
1261 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  33.93 
 
 
1281 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  34.54 
 
 
1257 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  38.69 
 
 
1406 aa  836    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  33.99 
 
 
1247 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  35.9 
 
 
1269 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1219  cobaltochelatase  36.86 
 
 
1285 aa  739    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0742888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  100 
 
 
1258 aa  2590    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  38.8 
 
 
1207 aa  788    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  35.57 
 
 
1270 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1859  Cobaltochelatase  36.6 
 
 
1302 aa  797    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.243773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2495  cobaltochelatase, CobN subunit  37.66 
 
 
1196 aa  770    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  35.5 
 
 
1253 aa  774    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1005  Cobaltochelatase  37.94 
 
 
1298 aa  814    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  35.63 
 
 
1263 aa  739    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1018  Cobaltochelatase  75.3 
 
 
1259 aa  2004    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  35.3 
 
 
1269 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  34.87 
 
 
1240 aa  657    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  35.47 
 
 
1278 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  36.61 
 
 
1364 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0120  cobaltochelatase  38.46 
 
 
1220 aa  872    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  39.2 
 
 
1409 aa  838    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0282  CobN/magnesium chelatase  38.15 
 
 
1255 aa  849    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  34.42 
 
 
1253 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  35.41 
 
 
1248 aa  677    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1611  cobaltochelatase, CobN subunit  35.71 
 
 
1207 aa  735    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316783  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  35.04 
 
 
1220 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  35.09 
 
 
1267 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  37.08 
 
 
1213 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  33.26 
 
 
1273 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  38.02 
 
 
1264 aa  823    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  37.1 
 
 
1444 aa  793    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  37.63 
 
 
1191 aa  777    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  35.83 
 
 
1269 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  36.45 
 
 
1198 aa  765    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  42.01 
 
 
1237 aa  890    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2482  cobaltochelatase, CobN subunit  36.86 
 
 
1203 aa  731    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.440822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  38.03 
 
 
1453 aa  818    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  38.08 
 
 
1426 aa  874    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  35.79 
 
 
1270 aa  705    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  35.63 
 
 
1248 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  35.56 
 
 
1194 aa  753    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  35.83 
 
 
1269 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0434  cobaltochelatase, CobN subunit  48.61 
 
 
1244 aa  1223    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.396305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0441  cobaltochelatase  35.11 
 
 
1192 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  34.25 
 
 
1260 aa  653    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  38.6 
 
 
1435 aa  863    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1598  cobaltochelatase subunit CobN  37.26 
 
 
1266 aa  754    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.977865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0496  cobaltochelatase  34.04 
 
 
1270 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176352  normal  0.833561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  37.83 
 
 
1222 aa  819    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1259  cobaltochelatase  61.86 
 
 
1256 aa  1633    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2082  cobaltochelatase  32.99 
 
 
1297 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1646  Cobaltochelatase  37.3 
 
 
1293 aa  731    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.45922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  38.44 
 
 
1238 aa  800    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  35 
 
 
1269 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2878  cobaltochelatase subunit CobN  35.99 
 
 
1190 aa  736    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0816  cobaltochelatase, CobN subunit  36.01 
 
 
1175 aa  671    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  36.45 
 
 
1198 aa  765    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  36.62 
 
 
1205 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  34.95 
 
 
1220 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  34.06 
 
 
1293 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  38.26 
 
 
1206 aa  789    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3461  CobN/magnesium chelatase  38.11 
 
 
1304 aa  808    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  33.82 
 
 
1247 aa  706    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  33.72 
 
 
1290 aa  707    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  34.24 
 
 
1267 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  35.38 
 
 
1253 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  35.25 
 
 
1212 aa  734    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  35.04 
 
 
1220 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  36.32 
 
 
1193 aa  762    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  37.89 
 
 
1222 aa  817    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  34.5 
 
 
1248 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  34.07 
 
 
1281 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  33.91 
 
 
1281 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  33.39 
 
 
1263 aa  631  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  33.39 
 
 
1263 aa  629  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  36.22 
 
 
1330 aa  628  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  33.14 
 
 
1249 aa  625  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  33.95 
 
 
1388 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  33.85 
 
 
1235 aa  624  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  33.22 
 
 
1263 aa  621  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  31.57 
 
 
1291 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  28.76 
 
 
1262 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.77 
 
 
1262 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  34.52 
 
 
1247 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0292  CobN/magnesium chelatase  31.42 
 
 
1239 aa  600  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.431661  normal  0.307495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>