More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0106 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1399  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.42 
 
 
450 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0106  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
450 aa  891    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0864  xanthine/uracil permease-like protein  32.36 
 
 
566 aa  210  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1664  xanthine/uracil permease family protein  31.13 
 
 
580 aa  196  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.139365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3234  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.24 
 
 
577 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627871  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0182  aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia  32.45 
 
 
529 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  26.82 
 
 
452 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  25.77 
 
 
452 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  26.17 
 
 
452 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  25.23 
 
 
451 aa  146  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  28.03 
 
 
461 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2628  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.14 
 
 
598 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0466  Xanthine/uracil/vitamin C permease  27.7 
 
 
549 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  27.21 
 
 
465 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  28.54 
 
 
462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  27.05 
 
 
468 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  28.6 
 
 
460 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  26.33 
 
 
465 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  28.31 
 
 
500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  26.59 
 
 
488 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  27.53 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  27.06 
 
 
647 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  27.46 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  26.12 
 
 
825 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  24.4 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  29.42 
 
 
466 aa  128  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  28.67 
 
 
459 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  27.64 
 
 
463 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  29.2 
 
 
466 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  25.45 
 
 
461 aa  126  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  25.05 
 
 
458 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  28.63 
 
 
463 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  29.02 
 
 
465 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  25.45 
 
 
461 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  23.93 
 
 
468 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  27.29 
 
 
458 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  25.45 
 
 
472 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  24.77 
 
 
458 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  25.34 
 
 
431 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  23.48 
 
 
486 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  26.21 
 
 
466 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  24.5 
 
 
462 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  26.82 
 
 
444 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  27.8 
 
 
566 aa  122  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  27.64 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  26.01 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  25.54 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  26.43 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  27.27 
 
 
440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  27.27 
 
 
440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  27.03 
 
 
440 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  27.03 
 
 
440 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  26.79 
 
 
440 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  25.52 
 
 
489 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2644  Xanthine/uracil/vitamin C permease  24.72 
 
 
571 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  26.79 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  26.79 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  26.79 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  26.79 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  26.79 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  26.79 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  24.18 
 
 
463 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  24.18 
 
 
463 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  25.93 
 
 
434 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  24.18 
 
 
463 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  27.85 
 
 
455 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  25.67 
 
 
496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  26.09 
 
 
482 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  28.25 
 
 
455 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  23.65 
 
 
517 aa  117  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  23.97 
 
 
463 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  25.51 
 
 
462 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  25.7 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  25.06 
 
 
462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  26.24 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3843  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.91 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3907  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.91 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  25.06 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  27.39 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  25.88 
 
 
468 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3829  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.91 
 
 
441 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  26.19 
 
 
469 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3951  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.91 
 
 
441 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  24 
 
 
466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4011  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.91 
 
 
441 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  25.17 
 
 
446 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  27.44 
 
 
451 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  24.83 
 
 
462 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  26.51 
 
 
466 aa  113  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  28.63 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>