24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03739 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  100 
 
 		 335 aa  678    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  58.93 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  59.25 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  38.89 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  41.84 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  40.64 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  41.99 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  35.25 
 
 		 357 aa  165  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 357 aa  165  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  40.22 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  37.2 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  36.25 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 432 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  38.13 
 
 		 430 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  35.91 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 430 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  35.86 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  30.73 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  28.99 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  26.01 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  28.03 
 
 		 392 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>