More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03580 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03580  partition protein  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  75 
 
 		 209 aa  330  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.7 
 
 		 213 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  70.75 
 
 		 213 aa  305  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.84 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  37.68 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  37.02 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  37.02 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  35.58 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.72 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 235 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  33.33 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.27 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  32.86 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  32.86 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  32.86 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  32.86 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.8 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  32.86 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.27 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  33.17 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.97 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  32.86 
 
 		 331 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  32.55 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.97 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  32.41 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.97 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.97 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  33.97 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  32.37 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  29.91 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.11 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  30.92 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  25.71 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  34.48 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  29.57 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.99 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.96 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  35.58 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.26 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.25 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.25 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.74 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.73 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.13 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  32.79 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.19 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.36 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.46 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.36 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.87 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.69 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.74 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.13 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.13 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.15 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.15 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.15 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.23 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.22 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.52 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.15 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.13 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.13 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.76 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.93 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.15 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  33.13 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.23 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>