31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02757 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02757  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  228  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  49.52 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0822  hypothetical protein  46.3 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000953829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  49.04 
 
 
110 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  48.08 
 
 
110 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5323  protein of unknown function DUF718  51.43 
 
 
109 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  43.27 
 
 
109 aa  100  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1543  hypothetical protein  46.23 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0311  protein of unknown function DUF718  49.04 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.881314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5480  protein of unknown function DUF718  45.79 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299938  normal  0.858981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  43.4 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6338  hypothetical protein  43.81 
 
 
109 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00357939  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1246  hypothetical protein  43.81 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1219  hypothetical protein  43.81 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3138  hypothetical protein  44.34 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0645  hypothetical protein  43.93 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1086  hypothetical protein  42.99 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1163  hypothetical protein  42.99 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0819  hypothetical protein  42.99 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1601  hypothetical protein  42.06 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1781  hypothetical protein  43.93 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2427  hypothetical protein  40.4 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40891  predicted protein  33.33 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3394  hypothetical protein  38.3 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  27.18 
 
 
832 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4974  hypothetical protein  31.63 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.112627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  26.92 
 
 
838 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0314  hypothetical protein  31.91 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2270  hypothetical protein  29.9 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4951  protein of unknown function DUF718  34.34 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0240  hypothetical protein  29.79 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>