More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00342 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
414 aa  818    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.18 
 
 
423 aa  605  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.51 
 
 
435 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.76 
 
 
425 aa  571  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.15 
 
 
418 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.7 
 
 
418 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.69 
 
 
418 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.5 
 
 
418 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.49 
 
 
418 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.04 
 
 
418 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.66 
 
 
418 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.96 
 
 
418 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.72 
 
 
418 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.77 
 
 
416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.36 
 
 
418 aa  441  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.45 
 
 
418 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.18 
 
 
413 aa  428  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.9 
 
 
416 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 
420 aa  421  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.4 
 
 
415 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.43 
 
 
415 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.51 
 
 
419 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.04 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.9 
 
 
415 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 
415 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.97 
 
 
456 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.62 
 
 
418 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.24 
 
 
414 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
415 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.79 
 
 
421 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
415 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
415 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 
411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.64 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.39 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.26 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.39 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.39 
 
 
417 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
415 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.13 
 
 
418 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.28 
 
 
413 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.28 
 
 
427 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.22 
 
 
421 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 
417 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.63 
 
 
419 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
418 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 
418 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.19 
 
 
418 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.47 
 
 
418 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.93 
 
 
423 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
419 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.12 
 
 
421 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.1 
 
 
415 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.12 
 
 
421 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.68 
 
 
415 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.84 
 
 
415 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.61 
 
 
415 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.3 
 
 
424 aa  383  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
430 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.79 
 
 
423 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.06 
 
 
425 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.8 
 
 
415 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0227  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 
428 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.287759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.38 
 
 
421 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
430 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.3 
 
 
424 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.55 
 
 
415 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.78 
 
 
415 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.62 
 
 
423 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.2 
 
 
415 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.12 
 
 
423 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 
415 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.49 
 
 
418 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0212  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.33 
 
 
427 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.65 
 
 
416 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 
415 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.91 
 
 
419 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.43 
 
 
419 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
423 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.65 
 
 
416 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.88 
 
 
421 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 
415 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.57 
 
 
417 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.96 
 
 
420 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.23 
 
 
413 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.34 
 
 
423 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.41 
 
 
416 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.15 
 
 
428 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.83 
 
 
423 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.28 
 
 
415 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.9 
 
 
441 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 
418 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 
418 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 
429 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.17 
 
 
416 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 
416 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.55 
 
 
450 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>