29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00227 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00511  TAL effector AvrBs3/PthA  92.13 
 
 		 623 aa  1094    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0108492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05633  TAL effector AvrBs3/PthA  92.87 
 
 		 904 aa  1570    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00212942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05609  TAL effector AvrBs3/PthA  88.97 
 
 		 1017 aa  1656    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03922  TAL effector AvrBs3/PthA  92.93 
 
 		 1037 aa  1792    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  93.59 
 
 		 1107 aa  1969    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02269  TAL effector AvrBs3/PthA  93.42 
 
 		 734 aa  1268    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.046405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02172  TAL effector AvrBs3/PthA  85.12 
 
 		 1086 aa  1674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01085  TAL effector AvrBs3/PthA  91.28 
 
 		 983 aa  1676    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000275966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00572  TAL effector AvrBs3/PthA  92.47 
 
 		 1047 aa  1828    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00567  TAL effector AvrBs3/PthA  91.62 
 
 		 810 aa  1401    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  92.24 
 
 		 969 aa  1654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  90.71 
 
 		 653 aa  1054    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00318  TAL effector AvrBs3/PthA  93.71 
 
 		 811 aa  1453    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.566935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00227  TAL effector AvrBs3/PthA  100 
 
 		 1267 aa  2492    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00223  TAL effector AvrBs3/PthA  85.43 
 
 		 1068 aa  1411    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  84.4 
 
 		 1483 aa  2140    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05718  TAL effector AvrBs3/PthA  92.35 
 
 		 868 aa  1486    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000318376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06229  TAL effector AvrBs3/PthA  92.87 
 
 		 904 aa  1570    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00614737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06234  TAL effector AvrBs3/PthA  91.28 
 
 		 983 aa  1676    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00915225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1815  hypothetical protein  51.85 
 
 		 1245 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1276 aa  92  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.63 
 
 		 1022 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1676 aa  63.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.93 
 
 		 1343 aa  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  29.18 
 
 		 1809 aa  58.5  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 1371 aa  57.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 3035 aa  52.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  20.5 
 
 		 1534 aa  50.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 450 aa  48.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>