13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5206 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5206  EF hand domain protein  100 
 
 		 310 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5210  EF hand domain protein  97.1 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  87.72 
 
 		 674 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5413  EF hand domain protein  64.23 
 
 		 792 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1774  hypothetical protein  47.64 
 
 		 697 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.426003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4026  EF hand domain-containing protein  48.15 
 
 		 196 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  32.34 
 
 		 889 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_5209  hypothetical protein  60 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01469  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  33.61 
 
 		 1054 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  31.53 
 
 		 989 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  29.73 
 
 		 964 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  29.17 
 
 		 931 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal  1 
 
 
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