More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3448 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3448  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 409 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3230  glycosyl transferase, group 1  85.09 
 
 		 409 aa  711    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2264  glycosyl transferase, group 1  61.32 
 
 		 385 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3127  glycosyl transferase, group 1  62.1 
 
 		 380 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.020191  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.77 
 
 		 856 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.77 
 
 		 856 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.77 
 
 		 820 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.77 
 
 		 820 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  62.77 
 
 		 820 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  61.14 
 
 		 821 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  62.77 
 
 		 820 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  61.14 
 
 		 821 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  62.77 
 
 		 820 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  63.76 
 
 		 821 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  60.64 
 
 		 821 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  62.83 
 
 		 857 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  60.4 
 
 		 819 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  60.4 
 
 		 822 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6492  glycosyl transferase, group 1  61.87 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737986  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6748  glycosyl transferase group 1  62.33 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  62.67 
 
 		 818 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  62.43 
 
 		 821 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1127  glycosyl transferase group 1  61.87 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.353198 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3728  glycosyl transferase group 1  61.02 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0346462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  61.52 
 
 		 828 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  61.85 
 
 		 820 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1357  glycosyl transferase, group 1  62.03 
 
 		 383 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.765434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0524  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.04 
 
 		 414 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0032  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.04 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0810  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.04 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0314392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2880  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.04 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.447923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0632  glycosyl transferase, group 1  63.04 
 
 		 413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2502  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.04 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0300016  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2204  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.04 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0647  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.04 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1680  glycosyl transferase group 1  60 
 
 		 405 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2536  putative first mannosyl transferase,o- antigen biosynthesis  60.64 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1810  glycosyl transferase, group 1  61.14 
 
 		 416 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6735  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  60.59 
 
 		 742 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1681  glycosyl transferase, group 1  59.35 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  55.38 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0294  aldehyde dehydrogenase  54.01 
 
 		 374 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0733  glycosyl transferase group 1  52.96 
 
 		 402 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1710  glycosyl transferase group 1  53.48 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.586278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4215  glycosyl transferase group 1  53.1 
 
 		 374 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0349  glycosyl transferase, group 1  53.95 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.329915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  52.69 
 
 		 389 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0836  glycosyl transferase group 1  50.81 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.367499  normal  0.134682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  51.87 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  49.2 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  50.67 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1689  glycosyl transferase, group 1  48.4 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0496  glycosyl transferase, group 1  46.63 
 
 		 371 aa  361  2e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  46.74 
 
 		 364 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3320  glycosyl transferase group 1  46.79 
 
 		 386 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2781  glycosyl transferase group 1  46.79 
 
 		 386 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  44 
 
 		 369 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2690  group 1 glycosyl transferase  45.84 
 
 		 378 aa  320  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.823218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3256  glycosyl transferase, group 1  44.92 
 
 		 385 aa  316  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3393  glycosyl transferase group 1  45.72 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2100  glycosyl transferase, group 1  44.24 
 
 		 381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  44.53 
 
 		 361 aa  299  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0836  glycosyltransferase  45.67 
 
 		 409 aa  296  3e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.260131  hitchhiker  0.000830652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2594  glycosyl transferase, group 1  42.78 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0321424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3532  glycosyl transferase group 1  43.55 
 
 		 389 aa  292  9e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0859  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984079  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20091  glycosyltransferase  44.03 
 
 		 410 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1553  glycosyltransferase  45 
 
 		 415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1037  putative glycosyltransferase group 1 family protein  43.08 
 
 		 380 aa  289  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0479  putative glycosyltransferase  45.59 
 
 		 366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3774  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3129  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 		 414 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3401  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4558  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13661  glycosyltransferase  40.91 
 
 		 401 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.244313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  43.01 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  43.28 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2700  glycosyl transferase, group 1  39.95 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4009  glycosyl transferase group 1  40.86 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0274  glycosyl transferase group 1  42.9 
 
 		 378 aa  257  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1177  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3451  glycosyl transferase group 1  40.44 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  41.51 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3665  glycosyl transferase group 1  39.78 
 
 		 363 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1115  glycosyl transferase, group 1  38.48 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.282541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3126  group 1 glycosyl transferase  39.7 
 
 		 366 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.154017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0414  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 363 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3205  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1577  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 		 371 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0548875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0019  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0112431  normal  0.0520774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  27.3 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0086  glycosyl transferase, group 1  57.41 
 
 		 122 aa  123  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>