59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4778 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  97.06 
 
 
102 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  42.28 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  32.59 
 
 
227 aa  72  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  29.61 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  30.84 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  33.06 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  30.84 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  29.63 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  40.38 
 
 
219 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  30.15 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  33.02 
 
 
208 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  28.03 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  38.68 
 
 
228 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  28.24 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  36.96 
 
 
249 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  30.19 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  31.21 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  32.74 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  30.65 
 
 
271 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  34.58 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  26.85 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  33.67 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 
247 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  31.46 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  31.73 
 
 
269 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  29.35 
 
 
273 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  29.12 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  38.81 
 
 
316 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  32.14 
 
 
264 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  30.36 
 
 
223 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  27.78 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  40.32 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  40.32 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  32.26 
 
 
311 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  40.32 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  40.32 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  40.32 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  32.41 
 
 
385 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18070  Ion channel  33.33 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00210304  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  41.79 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  41.67 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  37.5 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0591  putative potassium channel protein  35.24 
 
 
134 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0599184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  47.37 
 
 
279 aa  42.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  41.82 
 
 
274 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4786  putative potassium channel protein  36.47 
 
 
134 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0423111  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0540  putative potassium channel protein  36.47 
 
 
134 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  29.86 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  26.8 
 
 
265 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1362  Ion transport 2 domain protein  30.19 
 
 
134 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0590  potassium channel protein, putative  36.47 
 
 
134 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0503  potassium channel protein  36.47 
 
 
134 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0446  LCTB protein, potassium channel  36.47 
 
 
134 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0442  LCTB protein, potassium channel  36.47 
 
 
134 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0535  potassium channel protein  36.47 
 
 
134 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0211593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0518  putative potassium channel protein  36.47 
 
 
134 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000436021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
244 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>