28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4455 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  85.99 
 
 
255 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  44.95 
 
 
245 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  39.68 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  39.15 
 
 
186 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  38.1 
 
 
186 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  37.57 
 
 
186 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  38.1 
 
 
186 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  37.57 
 
 
186 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  37.04 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  36.7 
 
 
186 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  36.7 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  35.98 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  35.45 
 
 
186 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  34.92 
 
 
186 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  33.86 
 
 
186 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  38.62 
 
 
183 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  38.1 
 
 
183 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  35.08 
 
 
182 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  28.35 
 
 
193 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  29.74 
 
 
193 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  28.42 
 
 
193 aa  85.5  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  29.51 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  29.53 
 
 
209 aa  82  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  29.23 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  24.87 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  27.41 
 
 
194 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  26.47 
 
 
201 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>